京都大学化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
理論分子生物学分科
スタッフ
金久 實 教授
五斗 進 准教授
研究内容
研究テーマ: ゲノム解析によってもたらされる大量の情報から、細胞・個体・生態系といった高次生命システムを理解するためのバイオインフォマティクス研究を行っています。特に、生命のはたらきは個々の遺伝子あるいはタンパク質に還元できるものではなく、多数の遺伝子、タンパク質、低分子化合物をはじめとした多様な分子が複雑に相互作用したネットワークとして実現されている、という観点から、本研究室では、これらネットワークを解析する情報技術と、実験的に確かめられた様々なパスウェイの知識をコンピュータ表現し利用するデータベース技術の開発研究、およびその実用化を行っています。具体的には、生命科学の膨大な知識を物質間相互作用や化学反応に関する法則と関連付けて体系化した生命情報統合データベースKEGGの開発、大量データを効率的に扱う情報処理技術や機能未知遺伝子のアノテーションなどバイオ情報を統合するための基盤技術の開発を行っています。さらに、実験研究と比較してバイオインフォマティクス研究の特色は、大量かつ多様なデータを網羅的かつ統合的に解析できること、異なる生物種や異なる系を系統的に比較解析できること、そして実験事実と計算による予測を融合できることです。本研究室では、比較ゲノム解析、高次構造予測、発現プロファイル解析、ネットワーク解析、化合物構造解析、代謝ネットワーク予測など、生命システムの情報構築原理を解明することを目的としたバイオインフォマティクス研究も盛んに行っています。このような研究成果は、ゲノムネット(http://www.genome.jp)を通じて海外に発信しており、常に高い評価を得てきました。
知識を体系化しデータベースとして構築する作業や、生命現象をシステムレベルで解明するための各研究過程において、スーパーコンピューターを始めとする大型計算機たちの果たす役割が大きくなっています。写真は、スーパーコンピューター
本研究室では、化学研究所の所有するスーパーコンピューターなどを最大限に活用し、バイオインフォマティクス研究のための、最先端かつ国際的にも有数の研究基盤・リソースを整備・発展させてきました。写真は、KEGGデータベースのエントリーページ

